П'ять сил:
● Прилад, налаштований на стадію екстракції нуклеїнової кислоти та очищення
● Прилад, налаштований на модуль ультразвукової екстракції
● Прилад повністю автоматичний
● Прилад, налаштований на підсилення змінної температури
● Прилад налаштований із повністю закритим набором реагентів
1. Чи потрібно екстрагувати та очищати реагенти для виявлення нуклеїнових кислот?
Принцип детекції нуклеїнової кислоти полягає в наступному: під дією праймера ДНК-полімераза використовується для здійснення ланцюгової реакції ампліфікації на матричній ДНК/РНК (що потребує зворотної транскрипції NA), а потім визначається кількість вивільненого флуоресцентного сигналу для визначення чи містить зразок нуклеїнову кислоту (ДНК/РНК) збудника, який необхідно виявити.
1) Зразки, які не були екстраговані або очищені, можуть містити багато компонентів, які впливають на кінцевий результат: нуклеазу (яка може розчинити цільову нуклеїнову кислоту та спричинити хибнонегативний результат), протеазу (яка може зменшити ДНК-полімеразу та спричинити хибнонегативний результат), важкі метали сіль (що призводить до інактивації синтази та викликає хибнопозитивний результат), надто кислий або надто лужний PH (що може призвести до збою реакції), неповна РНК (що призводить до помилково негативної зворотної транскрипції).
2) Деякі зразки важко ампліфікувати безпосередньо: грампозитивні та деякі паразити через їх товсті клітинні стінки та інші структури, якщо вони не проходять через процес екстракції та очищення нуклеїнової кислоти, набір без екстракції може не працювати для таких зразки.
Тому рекомендується вибрати тестовий набір або інструмент, налаштований на етап екстракції нуклеїнової кислоти.
2. Хімічна екстракція чи фізична ультразвукова фрагментаційна екстракція?
Загалом, хімічна екстракція може бути застосована до більшості етапів попередньої обробки та очищення.Однак у товстостінних грампозитивних бактерій і деяких паразитів хімічна екстракція також не може отримати ефективні матриці нуклеїнової кислоти, що призводить до помилково негативного виявлення.Крім того, під час хімічної екстракції часто використовуються сильні агенти, якщо елюювання не є ретельним, у реакційну систему легко ввести сильний луг, що призведе до неточних результатів.
Ультразвукова фрагментація використовує фізичне дроблення, яке успішно застосовує GeneXpert, провідне підприємство в області POCT для використання людьми, і має абсолютну перевагу в екстракції нуклеїнової кислоти деяких складних зразків (таких як Mycobacterium tuberculosis).
Тому рекомендується вибрати тестовий набір або інструмент, налаштований на етап екстракції нуклеїнової кислоти.і оптимально, якщо є модуль ультразвукової витяжки.
3. Ручний, напівавтоматичний і повністю автоматичний?
Це проблема вартості праці та ефективності роботи.В даний час лікарні для домашніх тварин не мають достатнього персоналу, а виділення та виявлення нуклеїнових кислот — це робота, яка вимагає певних навичок і досвіду.Немає сумніву, що повністю автоматична машина для виділення та виявлення нуклеїнової кислоти є ідеальним вибором.
4. Постійне підвищення температури чи змінне підвищення температури?
Реакція ампліфікації є ланкою виявлення нуклеїнової кислоти, і професійна технологія, задіяна в цій ланці, є складною.Грубо кажучи, ферменти використовуються для ампліфікації нуклеїнової кислоти.У процесі ампліфікації виявляється посилений сигнал флуоресценції або вбудований сигнал флуоресценції.Загалом, чим раніше з’являється сигнал флуоресценції, тим більший вміст цільового гена в зразку.
Ампліфікація при постійній температурі є ампліфікацією нуклеїнової кислоти при фіксованій температурі, тоді як ампліфікація при змінній температурі є циклічною ампліфікацією строго відповідно до денатурації-відпалу-подовження.Було проведено постійний час підсилення температури, тоді як на змінний час підсилення температури значною мірою впливає швидкість підвищення та падіння температури приладу (на даний момент багато виробників можуть виконати 40 циклів підсилення приблизно за 30 хвилин).
Якщо лабораторні умови хороші, а зонування суворе, розумно сказати, що різниця в точності між ними не буде великою.Однак ампліфікація зі змінною температурою синтезує більше продуктів нуклеїнової кислоти за відносно коротший час.Для лабораторій без суворого зонування та професійної підготовки персоналу ризик витоку аерозолю нуклеїнової кислоти буде більшим, помилковий результат виникає, коли відбувається витік, і який надзвичайно важко усунути.
Крім того, ампліфікація при постійній температурі також більш схильна до неспецифічної ампліфікації, коли зразок є складним (відносна температура реакції нижча, і чим вища температура розширення, тим краща специфічність зв’язування праймера).
Що стосується поточної технології, посилення зі змінною температурою є більш надійним.
5. Як уникнути ризику витоку продуктів ампліфікації нуклеїнових кислот?
В даний час багато виробників обирають пробірку для ПЛР типу залози як пробірку для реакції нуклеїнової кислоти, яка герметично закривається тертям, і температурна денатурація в денатурації зі змінною температурою в ампліфікації ПЛР зі змінною температурою досягає 90 градусів.
за Цельсієм.Повторюваний процес розширення під дією тепла та звуження під впливом холоду є великою проблемою для герметизації пробірки ПЛР, а пробірку ПЛР із сальником відносно легко спричинити витік.
Бажано проводити реакцію з повністю герметичним набором/пробіркою, щоб уникнути витоку продукту реакції.Було б ідеально, якби можна було розробити повністю запечатаний набір для виділення та виявлення нуклеїнової кислоти.
Отже, нова повністю автоматична машина для екстракції та виявлення нуклеїнової кислоти від New Tech має п’ять перерахованих вище оптимальних варіантів.
Час публікації: 9 серпня 2023 р